微生物多样性通过检测细菌16S rRNA的基因可变区序列、真菌18S rRNA的基因可变区序列或真菌的内转录间隔区（ITS）序列的变异和数量，获取微生物群落的多样性和组成谱。二代测序是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法；DNA测序不依赖菌种本身特点，对所有菌种均可使用；比传统生化鉴定更加快速，准确。
实验流程:
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1. 细菌16S rDNA测序
2. 真菌18S rDNA测序
3. 真菌ITS测序
4. 三代全长测序
应用方向:
疾病标志物筛查、疾病机制研究、药理及药效分析、环境研究等
样本要求:
样本类型 | 送样量 | 生物学重复 | 保存/运输方式 |
土壤、污泥 | ≥3g | ≥3例 （临床样本≥10例） | 液氮速冻 -80℃保存 干冰运输 |
胃液/组织液 | ≥3ml |
粪便/肠道内容物 | ≥0.5g |
项目文章:
Zhou J, Xiong X, Yin J, et al. Dietary Lysozyme Alters Sow's Gut Microbiota, Serum Immunity and Milk Metabolite Profile. Front Microbiol. 2019;10:177
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